Um vírus inesperado destrói oitenta por cento da raça humana. Cientista rapidamente se move para salvar a humanidade, criando ciborgues que carregam o DNA humano de vinte por cento da raça humana. Os ciborgues tornam-se a apólice de seguro para a humanidade.
Existem apenas cem cyborgs criados e eles têm a capacidade de procriar e dar à luz seres humanos. Os ciborgues são programados para não procriar até que o vírus desapareça completamente.
Um homem caminha por uma paisagem vazia e vê uma cidade desolada ao longe. Então, ele caminha pela cidade onde as pessoas infectadas pelo vírus são colocadas em gaiolas, assando ao sol e deixadas para morrer.
Seu nome é Logan One e passa a ser um homem perseguido por caçadores de tesouros por algo valioso que ele está carregando. Ele é atacado por eles e consegue matar dois deles, mas o terceiro arranca sua mão direita. O caçador de tesouros está pronto para remover um coração mecânico de alta energia do corpo de Logan quando uma garota chamada Evelyn atira no caçador pelas costas, salvando Logan.
A garota o segue até em casa e ele mostra a ela o quão rápido ele pode consertar sua mão direita. Ele tem uma mão substituta em um armário que ele prende a si mesmo.
Quando é tarde demais para ela voltar, Logan oferece a ela um lugar em sua barraca diurna para que ela não fique doente com o vírus. A garota sabe que ele é um ciborgue e pergunta de onde ele veio. Ele responde que fazia parte de uma unidade de noventa e nove ciborgues que foram caçados e despojados de partes por caçadores saqueadores.
Ela o segue até uma caverna que ele mantém no topo de uma montanha há décadas. A caverna foi convertida em uma mansão. Ele então diz a ela para se sentir confortável.
Mas acontece que a garota trabalha para a Agência Central de Inteligência Serpente (SCI). Ela explica que restam apenas vinte e três humanos na Terra e dois trabalham para sua agência. Os dois homens em sua agência estão morrendo do vírus. Ela foi instruída a encontrá-lo porque ele é um dos dois ciborgues restantes que podem trazer a humanidade de volta da extinção. Evelyn, diz a Logan que eles devem encontrar o outro ciborgue antes que o caçador de tesouros chegue até ela.
Ela acorda mais tarde e Logan se foi, mas ela vê um alarme disparando no quarto e percebe que uma nave pousou perto de seu esconderijo no monitor de segurança.
No navio, um chefe chamado Jake e vinte caçadores de tesouros saem. Logan elimina um caçador de tesouros chamado Chuck enquanto eles correm para o topo da montanha, para chegar a Logan. Mais tarde, Logan luta com um cara chamado Kilroy. Ele está prestes a derrubá-lo quando o amigo de Kilroy entra na sala com uma arma. Logan se coloca atrás de Kilroy para evitar a arma de seu amigo. Kilroy implora a seu amigo para não atirar, mas ele escolhe atirar através dele para matar Logan.
Logan consegue escapar. Ele então tira todos os caçadores de tesouros, exceto o chefe Jake. Logan, de repente, leva um tiro de Jake algumas vezes, e um tiro abre um buraco na perna de Logan. Jake então culpa Logan por matar os últimos vinte humanos restantes na Terra. Mais tarde, Evelyn vem e explode a cabeça de Jake, à distância. Infelizmente, Jake conseguiu dar um tiro antes de ser atingido por Evelyn. Metade do rosto de Evelyn é explodido quando Jake cai no chão.
O lado esquerdo do rosto danificado de Evelyn mostra que ela é a ciborgue feminina desaparecida. Mais tarde, ela diz a Logan como ela não sabia que ela era um ciborgue, e como sua agência a fez acreditar que ela era uma humana que já teve mãe e pai.
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